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| 标准编号 | SN/T 4626-2016 (SN/T4626-2016) | | 中文名称 | DNA条形码物种鉴定操作规程 | | 英文名称 | Protocol for species identification based on DNA barcode databases | | 行业 | 商检行业标准 (推荐) | | 中标分类 | C62 | | 字数估计 | 10,195 | | 发布日期 | 2016-08-23 | | 实施日期 | 2017-03-01 | | 标准依据 | 国质检认(2016)438号;行业标准备案公告2017年第8号(总第212号) | | 发布机构 | 海关总署 |
SN/T 4626-2016
(DNA barcode species identification procedures)
中华人民共和国出入境检验检疫行业标准
DNA条形码物种鉴定操作规程
2016-08-23发布
2017-03-01实施
中 华 人 民 共 和 国
国家质量监督检验检疫总局 发 布
前言
本标准按照GB/T 1.1-2009给出的规则起草。
本标准由国家认证认可监督管理委员会提出并归口。
本标准起草单位:中国检验检疫科学研究院、国家质检总局信息中心、山东出入境检验检疫局。
本标准主要起草人:陈岩、张燕平、迟海英、赵文军、吴绍强、朱水芳。
DNA条形码物种鉴定操作规程
1 范围
本标准规定了我国检疫性有害生物DNA条形码鉴定系统的鉴定流程。
本标准适用于我国动物、植物与口岸卫生检疫性有害生物的DNA条形码物种鉴定。
2 术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
2.1
DNA条形码技术DNAbarcoding
利用标准化的、有足够变异的、易扩增且相对较短的基因片段,用于物种鉴定和新种发现的生物身
份识别技术。
2.2
tinepests
网址http:∥www.qbol.org.cn。
2.3
S值与E 值 S-scoreandE-value
S值(S-score)表示两条DNA序列(查询序列和目标序列)的相似程度,分值越高表明它们之间相
似的程度越大。E 值(E-value)是S值可靠性的评价。E 值表示在随机情况下,其他目标序列与查询
序列的相似度要高于查询序列和目标序列相似度的可能性。E 值越低,S值越可靠,也就是说目标序列
和查询序列相似度越高。当E 值小于10-5时,表明两序列有较高的相似性。
2.4
FASTA格式 FASTAformat
在生物信息学中,一种基于文本用于表示核苷酸序列或氨基酸序列的格式。在这种格式中碱基对
或氨基酸用单个字母来编码,且允许在序列前添加序列名和注释。序列文件的第一行是由大于号“ >”
开始,用于序列标记。从第二行开始为序列信息,只允许使用既定的核苷酸或氨基酸编码符号。通常核
苷酸符号大小写均可,而氨基酸只用大写字母。
注:示例参见附录A。
2.5
DNA条形码 DNAbarcodes
CO1:线粒体细胞色素c氧化酶亚基1,动物DNA条形......
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