[PDF] SN/T 4877.14-2019 - 英文版
| 标准号码 | 美元 | 购买PDF | 工期 | 标准名称(英文版) |
| SN/T 4877.14-2019 | 239 | SN/T 4877.14-2019 | <=3 | 基因条形码筛查方法 第14部分:检疫性南方菜豆花叶病毒属病毒 |
| 基本信息 | |
|---|---|
| 标准编号 | SN/T 4877.14-2019 (SN/T4877.14-2019) |
| 中文名称 | 基因条形码筛查方法 第14部分:检疫性南方菜豆花叶病毒属病毒 |
| 英文名称 | DNA barcoding screening method - Part 13: Qurantine Sobemoviruses |
| 行业 | 商检行业标准 (推荐) |
| 中标分类 | C62 |
| 国际标准分类 | |
| 字数估计 | 11,167 |
| 发布日期 | 2019-09-03 |
| 实施日期 | 2020-03-01 |
| 标准依据 | 海关总署公告2019年第142号 |
| 发布机构 | 海关总署 |
SN/T 4877.14-2019: 基因条形码筛查方法 第14部分:检疫性南方菜豆花叶病毒属病毒
SN/T 4877.14-2019 英文名称: DNA barcoding screening method - Part 13: Qurantine Sobemoviruses
中华人民共和国出入境检验检疫行业标准
SN/T4877.14-2019
基因条形码筛查方法
第14部分:检疫性南方菜豆花叶病毒属病毒
中华人民共和国海关总署 发 布
前言
本部分按照GB/T 1.1-2009给出的规则起草。
请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布
机构不承担识别这些专利的责任。
本部分由中华人民共和国海关总署提出并归口。
本部分起草单位:中华人民共和国北京海关、中华人民共和国厦门海关。
本部分主要起草人:邓丛良,陈红运、赵晓丽、吕玉峰、骆卫峰、刘兴亮、郑春生。
SN/T4877.14-2019
SN/T 4877《基因条形码筛查方法》分为15个部分:
- - 第 1 部 分 : 检 疫 性 棒 形 杆 菌 ;
- - 第 2 部 分 : 检 疫 性 黄 单 胞 菌 ;
- - 第 3 部 分 : 检 疫 性 植 原 体 ;
- - 第 4 部 分 : 检 疫 性 茎 点 霉 ;
- - 第 5 部 分 : 检 疫 性 拟 茎 点 霉 ;
- - 第 6 部 分 : 检 疫 性 嗜 酸 菌 ;
- - 第 7 部 分 : 检 疫 性 轮 枝 菌 ;
- - 第 8 部 分 : 检 疫 性 炭 疽 菌 ;
- - 第 9 部 分 : 检 疫 性 腥 黑 粉 菌 ;
- - 第 1 0 部 分 : 检 疫 性 疫 霉 ;
- - 第 1 1 部 分 : 检 疫 性 异 株 苋 亚 属 ;
- - 第 1 2 部 分 : 黄 瓜 绿 斑 驳 花 叶 病 毒 ;
- - 第 1 3 部 分 : 检 疫 性 马 铃 薯 Y 病 毒 属 病 毒 ;
- - 第 1 4 部 分 : 检 疫 性 南 方 菜 豆 花 叶 病 毒 属 病 毒 ;
- - 第 1 5 部 分 : 检 疫 性 叶 点 霉 。
本 部 分 为 SN/T 4877的 第 1 4 部 分 。
基因条形码筛查方法
第14部分:检疫性南方菜豆花叶病毒属病毒
1 范围
本部分规定了检疫性南方菜豆花叶病毒属病毒的基因条形码筛查方法中RNA提取、基因扩增、序
列的比对分析及结果判定等。
本部分适用于植物繁殖材料及植物产品中检疫性南方菜豆花叶病毒属病毒的筛查检测。
2 规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本
文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
SN/T 3438 南方菜豆花叶病毒检疫鉴定方法。
SN/T 3436 藜草花叶病毒检疫鉴定方法。
4 南方菜豆花叶病毒属基本信息
中文名称:南方菜豆花叶病毒属
该属病毒可侵染单子叶植物和双子叶植物,但每个病毒的自然寄主范围相对窄,病害症状主要是花
属的其他信息参见附录A。
5 原理
即为该属的条形码特征序列,根据此保守区域设计简并引物,进行RT-PCR扩增和PCR产物测序,实
6 仪器和试剂
6.1 仪器与设施
酶联检测仪、电子天平(感量0.0001g)、定性PCR仪、电泳仪、电泳槽、凝胶成像系统、恒温水浴、低
温冰箱、普通冰箱、离心机等;微量移液器(2.5μL,10μL,20μL,100μL,200μL,1000μL);酶联板、研钵等;隔离温室。
6.2 试剂
试剂见附录B。
7 制样
挑取畸形、不成熟的种子播于灭菌土中,待长出3-4片真叶后将表现症状的植株编号,未表现症状
的植株分组(10株为1组)并编号。
8 DNA条形码筛查
分别提取样品和对照的总RNA,反转录合成cDNA后,进行PCR扩增。健康的植物组织作阴性对
照,感染SBMV的植物组织作阳性对照,用无菌水作空白对照。
具体操作见附录B。
9 结果判定
9.1 通用RT-PCR方法检测结果为阴性,则判定未检出南方菜豆花叶病毒属病毒。
9.2 通用RT-PCR方法检测结果为阳性,则进行序列测定与分析:
a) 如果翻译后氨基酸序列与南方菜豆花叶病毒属已知病毒序列(参见附录C)同源性大于95%,
则判定检出南方菜豆花叶病毒属病毒(具体病毒种类还需采用其他方法进一步鉴定)。
b) 如果翻译后氨基酸序列与南方菜豆花叶病毒属已知病毒序列同源性低于95%:
---如果系统发育分析表明与南方菜豆花叶病毒属病毒聚为一群,则判定检出南方菜豆花叶
病毒属病毒(具体病毒种类还需采用其他方法进一步鉴定);
注:所检测到的病毒可能属于基因组序列尚未测定的已知病毒或尚未报道的新的病毒种类。
---如果系统发育分析表明与南方菜豆花叶病毒属病毒未聚为一群,则判定未检出南方菜豆
花叶病毒属病毒。
c) 如果测定的基因组序列与南方菜豆花叶病毒属中的SBMV和SoMV病毒同源性最高,则判定
筛查出检疫性植物病毒,需要根据标准方法(SN/T 3438和SN/T 3436)......