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[PDF] WS/T 594-2018 - 英文版

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WS/T 594-2018 249 WS/T 594-2018 <=3 蝇类抗药性检测方法 家蝇不敏感乙酰胆碱酯酶等位基因检测法
基本信息
标准编号 WS/T 594-2018 (WS/T594-2018)
中文名称 蝇类抗药性检测方法 家蝇不敏感乙酰胆碱酯酶等位基因检测法
英文名称 Test methods of fly resistance to insecticides-A molecular method for detecting insensitive ace allele in the Musca domestica
行业 卫生行业标准 (推荐)
中标分类 C05
字数估计 10,179
发布日期 2018-03-01
实施日期 2018-08-01
标准依据 国卫通(2018)3号
发布机构 卫生健康委员会

WS/T 594-2018 Test methods of fly resistance to insecticides-A molecular method for detecting insensitive ace allele in the Musca domestica ICS 11.020 C 05 WS 中华人民共和国卫生行业标准 蝇类抗药性检测方法 家蝇不敏感乙酰胆碱 酯酶等位基因检测法 Test methods of fly resistance to insecticides-A molecular method for detecting insensitive ace allele in the Musca domestica 2018 - 03 - 01发布 2018 - 08 - 01实施 中国人民共和国国家卫生和计划生育委员会发布 前言 本标准按照GB/T 1.1-2009给出的规则起草。 本标准主要起草单位:中国科学院动物研究所、北京市疾病预防控制中心、扬州大学、中国疾病预 防控制中心传染病预防控制所、中国农业大学、中国人民解放军军事科学院军事医学研究院微生物流行 病研究所、上海市疾病预防控制中心。 本标准主要起草人:邱星辉、李梅、曾晓芃、钱坤、周小洁、李静、刘起勇、高希武、赵彤言、冷 培恩。 蝇类抗药性检测方法 家蝇不敏感乙酰胆碱酯酶等位基因检测法 1 范围 本标准规定了家蝇不敏感乙酰胆碱酯酶等位基因的检测方法。 本标准适用于家蝇乙酰胆碱酯酶第342氨基酸位点基因型的检测。 2 术语和定义 下列术语和定义适用于本文件。 2.1 乙酰胆碱酯酶 acetyl cholinesterase 存在于生物体的一种水解酶,由乙酰胆碱酯酶基因ace编码。 2.2 等位基因 allele 存在于同一物种的相同基因的不同形式互称为等位基因。 2.3 342G、342V 和 342A 342G、342V和342A分别表示家蝇乙酰胆碱酯酶第342氨基酸残基位点上的氨基酸为甘氨酸(Gly)、 缬氨酸(Val)和丙氨酸(Ala)。 3 样本采集 采用诱捕或网捕等方法从现场采集家蝇成虫内,浸泡在100%乙醇溶液中带回实验室。浸泡样品可在 4 ℃条件下短期(6个月内)保存,可在-20 ℃以下长期保存。 4 引物 录A。配制为10 μmol/L浓度,保存于-20 ℃冰柜。 5 仪器设备 5.1 PCR(聚合酶链式反应)仪。 5.2 琼脂糖凝胶电泳仪。 5.3 凝胶成像仪。 5.4 恒温水浴锅。 6 主要试剂 6.1 DNA聚合酶(Taq酶)。 6.2 限制性内切酶Bsp1286I。 6.3 限制性内切酶Eae I。 7 操作步骤 7.1 在 PCR管中加入 10×PCR 缓冲液 (含 100 mmol/L Tris-HCl, 500 mmol/L KCl, 15 mmol/L MgCl2) 2.5 μL,dNTP(2.5 mmol/L)2.0 μL,引物 F 0.5 μL,引物 R 0.5 μL,单头家蝇的基因组 DNA 1 μL (100 ng~300 ng,提取方法可参见附录 B,也可用商售的 DNA提取试剂盒或其他类似方法提取)和 Taq 酶 (2~5个单位),用灭菌水补齐至 25 μL,混匀。 7.2 将 PCR管放入 PCR 仪中,设置 PCR反应程序为:94 ℃ 3 min;94 ℃ 30 s,50 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,35个循环;72 ℃ 10 min。运行程序。 7.3 PCR运行结束后,取 5 μL PCR产物在 1.5% 的琼脂糖凝胶上进行电泳,电压设定在 160 V,电泳 20 min后在紫外光下检测,有清楚单一的 609bp 的条带的 PCR产物用于进行以下酶切反应。 7.4 取合格样品(即电泳检测产物为 609bp)的 PCR产物设置两个酶切反应,反应 A 用 Bsp1286I酶、 反应 B用 Eae I酶进行酶切,酶切反应体系的设置根据酶产品的使用说明进行(参见附录 C)。 7.5 将酶切后的产物上样在 1.5% 的琼脂糖凝胶上,电压设定在 160 V,电泳 20 min后在紫外光下检 测。 8 基因型确定 根据酶切产物的电泳结果(参见附录 D),确定家蝇个体的乙酰胆碱酯酶的基因型,见表 1。 表1 家蝇个体乙酰胆碱酯酶的基因型确定 反应 I (加 Bsp1286I 酶切) 反应 II (加 Eae I 酶切) 乙酰胆碱酯酶 342 氨基酸位点基因型 361bp 、248bp 609bp 敏感型纯合子 (G/G) 609bp 609bp 不敏感 I 型纯合子(V/V) 609bp 361bp、248bp 不敏感 II 型纯合子(A/A) 609bp、361bp、248bp 609bp 不敏感 I 型/敏感型杂合子(G/V) 609bp、361bp、248bp 609bp、361bp、248bp 不敏感 II 型/敏感型杂合子 (G/A ) 609bp 609bp、361bp、248bp 不敏感 I 型/不敏感 II 型杂合子(V/A ) 注:G 表示氨基酸残基为 Gly(甘氨酸);V 表示氨基酸残基为 Val(缬氨酸);A 表示氨基酸残基为 Aal(丙 氨酸)。 A A 附 录 A (资料性附录) 引物设计参照序列 342V GCGGTTACG 342A GCGGTTACG 342G GCGGTTACG 注:下划线分别对应上游引物与下游引物序列(反向互补); 方框内为编码342位氨基酸的密码子。 B B 附 录 B (资料性附录) 家蝇基因组 DNA 提取方法 B.1 取单头家蝇,去除腹部后置于 1.5mL体积的离心管 (eppendorf 管) 中,加入 0.5 mL 新鲜配制的 裂解液(含 100 mmol/L Tris-HCl pH 8.0,10 mmol/L EDTA,50 mmol/L NaCl, 1% SDS, 0.15 mmol/L 精胺,0.5 mmol/L 亚精胺 和 2 U/mL的蛋白酶K),碾磨将虫体捣碎,置 60 ℃温浴, 20 min后取出。 B.2 加入 75 μL的 8 M醋酸钾,混匀,置冰上 10 min。 B.3 14000 g 离心 5 min,取 400 μL上清液转至新的离心管。 B.4 加入 800 μL 冰冷的 100%乙醇,室温放置 10 min B.5 离心 10 min,弃上清,离心沉淀用 500 μL的 70%乙醇清洗。 B.6 离心 5 min,沉淀干燥后(可置超净台中,开通风),加入 50 μL灭菌水或TE缓冲液 (10 mmol/L Tris-HCl,1 mmol/L EDTA,pH=8.0)中溶解。提取的DNA样品可直接用于PCR。样品 保存 4 ℃备用,也可于-20 ℃中长期保存。 C C 附 录 C (资料性附录) 酶切体系设置范例 C.1 酶切反应体系的设置见表C.1。 表C.1 酶切反应体系 成分 10×NEBuffer 4 100×BSA Bsp1286I Eae I PCR产物 灭菌水 反应 A 2 μL 0.5 μL 0.5 μL 0 1 μg 补至20 μL 反应B 2 μL 0 0 0.5 μL 1 μg 补至20 μL 注:采用限制性内切酶Bsp1286I, EaeI。10×NEBuffer 4和100×BSA随酶提供,其中 1×NEBuffer 4 含 50 mmol/L KAc,20 mmol/L Tris-Ac,10 mmol/L Mg(Ac)2,1 mmol/L DDT,pH7.9 (25 ℃ 测定),100× BSA 成分为10 mg/mL的BSA (牛血清白蛋白)。 C.2 37℃下进行温浴,时间 2h~4h,反应结束,直接用于电泳检测。 D D 附 录 D (资料性附录) 家蝇乙酰胆碱酯酶 342位点不同基因型 PCR产物的酶切结果 家蝇乙酰胆碱酯酶342位点不同基因型的PCR产物酶切结果见图D.1。 G--氨基酸残基为Gly(甘氨酸); V--氨基酸残基为Val(缬氨酸); A--氨基酸残基为Aal(丙氨酸); G/G--敏感型纯合子; V/V--不敏感 I型纯合子; A/A--不敏感II......

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