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[PDF] SN/T 4877.14-2019 - 英文版

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SN/T 4877.14-2019	英文版	239	SN/T 4877.14-2019	[PDF]天数 >=3	基因条形码筛查方法第14部分：检疫性南方菜豆花叶病毒属病毒	有效

基本信息
标准编号	SN/T 4877.14-2019 (SN/T4877.14-2019)
中文名称	基因条形码筛查方法第14部分：检疫性南方菜豆花叶病毒属病毒
英文名称	DNA barcoding screening method - Part 13: Qurantine Sobemoviruses
行业	商检行业标准 (推荐)
中标分类	C62
国际标准分类
字数估计	11,167
发布日期	2019-09-03
实施日期	2020-03-01
标准依据	海关总署公告2019年第142号
发布机构	海关总署

SN/T 4877.14-2019: 基因条形码筛查方法第14部分：检疫性南方菜豆花叶病毒属病毒 SN/T 4877.14-2019 英文名称: DNA barcoding screening method - Part 13: Qurantine Sobemoviruses 中华人民共和国出入境检验检疫行业标准 SN／T４８７７．１４-２０１９基因条形码筛查方法第１４部分：检疫性南方菜豆花叶病毒属病毒中华人民共和国海关总署发布前言本部分按照GB/T １．１-２００９给出的规则起草。请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别这些专利的责任。本部分由中华人民共和国海关总署提出并归口。本部分起草单位：中华人民共和国北京海关、中华人民共和国厦门海关。本部分主要起草人：邓丛良，陈红运、赵晓丽、吕玉峰、骆卫峰、刘兴亮、郑春生。 SN／T４８７７．１４-２０１９ SN/T 4877《基因条形码筛查方法》分为15个部分： - - 第 1 部分：检疫性棒形杆菌； - - 第 2 部分：检疫性黄单胞菌； - - 第 3 部分：检疫性植原体； - - 第 4 部分：检疫性茎点霉； - - 第 5 部分：检疫性拟茎点霉； - - 第 6 部分：检疫性嗜酸菌； - - 第 7 部分：检疫性轮枝菌； - - 第 8 部分：检疫性炭疽菌； - - 第 9 部分：检疫性腥黑粉菌； - - 第 1 0 部分：检疫性疫霉； - - 第 1 1 部分：检疫性异株苋亚属； - - 第 1 2 部分：黄瓜绿斑驳花叶病毒； - - 第 1 3 部分：检疫性马铃薯 Y 病毒属病毒； - - 第 1 4 部分：检疫性南方菜豆花叶病毒属病毒； - - 第 1 5 部分：检疫性叶点霉。本部分为 SN/T 4877的第 1 4 部分。基因条形码筛查方法第１４部分：检疫性南方菜豆花叶病毒属病毒１　范围本部分规定了检疫性南方菜豆花叶病毒属病毒的基因条形码筛查方法中ＲＮＡ提取、基因扩增、序列的比对分析及结果判定等。本部分适用于植物繁殖材料及植物产品中检疫性南方菜豆花叶病毒属病毒的筛查检测。２　规范性引用文件下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件，仅所注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件，其最新版本（包括所有的修改单）适用于本文件。ＳＮ/T ３４３８　南方菜豆花叶病毒检疫鉴定方法。ＳＮ/T ３４３６　藜草花叶病毒检疫鉴定方法。４　南方菜豆花叶病毒属基本信息中文名称：南方菜豆花叶病毒属该属病毒可侵染单子叶植物和双子叶植物，但每个病毒的自然寄主范围相对窄，病害症状主要是花属的其他信息参见附录Ａ。５　原理即为该属的条形码特征序列，根据此保守区域设计简并引物，进行ＲＴ-ＰＣＲ扩增和ＰＣＲ产物测序，实６　仪器和试剂６．１　仪器与设施酶联检测仪、电子天平（感量０．０００１ｇ）、定性ＰＣＲ仪、电泳仪、电泳槽、凝胶成像系统、恒温水浴、低温冰箱、普通冰箱、离心机等；微量移液器（２．５μＬ，１０μＬ，２０μＬ，１００μＬ，２００μＬ，１０００μＬ）；酶联板、研钵等；隔离温室。６．２　试剂试剂见附录Ｂ。７　制样挑取畸形、不成熟的种子播于灭菌土中，待长出３-４片真叶后将表现症状的植株编号，未表现症状的植株分组（１０株为１组）并编号。８　DNA条形码筛查分别提取样品和对照的总ＲＮＡ，反转录合成ｃＤＮＡ后，进行ＰＣＲ扩增。健康的植物组织作阴性对照，感染ＳＢＭＶ的植物组织作阳性对照，用无菌水作空白对照。具体操作见附录Ｂ。９　结果判定９．１　通用ＲＴ-ＰＣＲ方法检测结果为阴性，则判定未检出南方菜豆花叶病毒属病毒。９．２　通用ＲＴ-ＰＣＲ方法检测结果为阳性，则进行序列测定与分析：ａ）　如果翻译后氨基酸序列与南方菜豆花叶病毒属已知病毒序列（参见附录Ｃ）同源性大于９５％，则判定检出南方菜豆花叶病毒属病毒（具体病毒种类还需采用其他方法进一步鉴定）。ｂ）　如果翻译后氨基酸序列与南方菜豆花叶病毒属已知病毒序列同源性低于９５％： ---如果系统发育分析表明与南方菜豆花叶病毒属病毒聚为一群，则判定检出南方菜豆花叶病毒属病毒（具体病毒种类还需采用其他方法进一步鉴定）；注：所检测到的病毒可能属于基因组序列尚未测定的已知病毒或尚未报道的新的病毒种类。 ---如果系统发育分析表明与南方菜豆花叶病毒属病毒未聚为一群，则判定未检出南方菜豆花叶病毒属病毒。ｃ）　如果测定的基因组序列与南方菜豆花叶病毒属中的ＳＢＭＶ和ＳｏＭＶ病毒同源性最高，则判定筛查出检疫性植物病毒，需要根据标准方法（ＳＮ/T ３４３８和ＳＮ/T ３４３６）......

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