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| 标准编号 | SN/T 4876.7-2019 (SN/T4876.7-2019) | | 中文名称 | DNA条形码方法 第7部分:一品红亚属 | | 英文名称 | (DNA barcode method Part 7: Poinsettia subgenus) | | 行业 | 商检行业标准 (推荐) | | 中标分类 | B16 | | 国际标准分类 | | | 字数估计 | 12,132 | | 发布日期 | 2019-09-03 | | 实施日期 | 2020-03-01 | | 标准依据 | 海关总署公告2019年第142号 | | 发布机构 | 海关总署 |
SN/T 4876.7-2019: DNA条形码方法 第7部分:一品红亚属
SN/T 4876.7-2019 英文名称: (DNA barcode method Part 7: Poinsettia subgenus)
中华人民共和国出入境检验检疫行业标准
SN/T4876.7-2019
DNA条形码方法 第7部分:一品红亚属
中华人民共和国海关总署 发 布
前言
本部分按照GB/T 1.1-2009给出的规则起草。
请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布
机构不承担识别这些专利的责任。
本部分由中华人民共和国海关总署提出并归口。
本部分起草单位:宁波检验检疫科学技术研究院,中华人民共和国南京海关动植物与食品检测中
心,中华人民共和国上海海关动植物与食品检验检疫技术中心,中华人民共和国广州海关,中国检验检
疫科学研究院,中华人民共和国福州海关,中华人民共和国青岛海关。
本部分起草人:徐瑛,伏建国,印丽萍,张吉红,张慧丽,傅艺宁,吴海荣,范晓红,于文涛,宋涛。
SN/T4876.7-2019
SN/T 4876《DNA条形码方法》分为7个部分:
- - 第 1 部 分 : 检 疫 性 乳 白 蚁 ;
- - 第 2 部 分 : 检 疫 性 断 眼 天 牛 ;
- - 第 3 部 分 : 检 疫 性 卷 蛾 ;
- - 第 4 部 分 : 检 疫 性 高 粱 属 ;
- - 第 5 部 分 : 曼 陀 罗 属 ;
- - 第 6 部 分 : 瘤 背 豆 象 属 ;
- - 第 7 部 分 : 一 品 红 亚 属 。
本 部 分 为 SN/T 4876的 第7部 分 。
DNA条形码方法 第7部分:一品红亚属
1 范围
本部分规定了大戟属一品红亚属常见种的DNA条形码检测方法。
本部分适用于大戟属一品红亚属常见种的DNA条形码的测定、结果的比对分析与判定。
2 规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本
文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T 32142 齿裂大戟检疫鉴定方法
4 一品红亚属基本信息
大戟属是被子植物中特大属之一,约2000种,遍布世界各地,其中以非洲和中南美洲较多;我国检
Mayfield(1997)对大戟属一品红亚属的分类处理,该亚属在全球约24种,大部分为局部分布,有的甚至
戟、戴维大戟和白苞猩猩草为有害杂草,一品红和猩猩草为园林植物。近似种信息详见GB/T 32142。
5 方法原理
鉴定。
6 仪器设备和主要试剂
6.1 仪器设备与用具
PCR仪、电子天平(感量0.001g)、冷冻混合研磨仪、电泳仪、凝胶成像系统、高速冷冻离心机、解剖
镜、涡旋振荡器、冰箱、水浴锅、测序仪、高压灭菌锅、可调式微量移液器(2μL、10μL、20μL、100μL、
200μL,1000μL)及相应吸头、离心管、PCR管等。
6.2 主要试剂
除另有规定外,所有试剂均为分析纯或生化试剂。
植物基因组提取试剂盒、超纯水、DNAMarker、琼脂糖、核酸凝胶染料、液氮、脱氧核糖核苷三磷酸
(dNTPs)、Taq酶、10×PCR缓冲液、10×加样缓冲液,50×TAE缓冲液、引物(见附录B.1)。CTAB法
提取试剂(参见附录A.1)。
7 筛查鉴定方法
7.1 样品的处理
样品鉴定见GB/T 32142。将需要提取DNA的植物材料(种子为1粒-2粒,硅胶干燥的叶片为
10mg),放入2mL圆底离心管中,每个管内加2粒钢珠,加液氮后使用冷冻混合研磨仪研磨3min
(30次/秒)。
7.2 DNA制备
使用商品化的植物基因组提取试剂盒或采用改良的CTAB法提取植物基因组总DNA。改良的
CTAB法方法参见附录A.2。
7.3 DNA条形码基因片段扩增
条件见附录B。
7.4 PCR产物的检测
7.5 测序与序列处理
取剩余的PCR扩增产物45μL,经1.5%琼脂糖凝胶电泳分离,目的片段使用DNA产物纯化试剂盒纯化并测序。测序引物与PCR扩增引物相同。
测序结果利用序列拼接软件进行拼接编辑,对比峰图,判断序列方向,去除测序引物序列,两端测序
质量Q值<20的序列去除。
8 结果判定
8.1 中国检疫性有害生物DNA条形码鉴定系统判定
登录中国检疫性有害生物DNA条形码鉴定系统(http://www.qbol.org.cn),点击“物种识别”导航
条,进入物种识别页面。在鉴定框内输入FASTA格式 (或纯文本格式)序列后,点击“提交鉴定”,系统
进行BLAST后,自动生成鉴定结果(参见附录C)。当相似度最高的10条序列为相同物种,最大相似
辅以其他鉴定方法。
8.2 植物有害生物检疫鉴定系统判定
登陆植物有害生物检疫鉴定系统(http://www.exoticorganism.com),使用基因条码分析软件对查
询序列进行分析比对,对符合该类群鉴定特征的且相似度为100%的物种判定为该未知种。ITS2和
物有害生物检疫鉴定系统”操作方法参见附录D。
8.3 国际通用数据库判定
登录GenBank数据库BLAST鉴定系统(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)对获得的ITS2
该物种。齿裂大戟及常见近似种基因序列信息见参......
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