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| 标准编号 | SN/T 5106-2019 (SN/T5106-2019) | | 中文名称 | 登革热媒介蚊类DNA条形码鉴定方法 | | 英文名称 | (Dengue vector mosquito DNA barcode identification method) | | 行业 | 商检行业标准 (推荐) | | 中标分类 | C62 | | 国际标准分类 | | | 字数估计 | 13,128 | | 发布日期 | 2019-09-03 | | 实施日期 | 2020-03-01 | | 标准依据 | 海关总署公告2019年第142号 | | 发布机构 | 海关总署 |
SN/T 5106-2019: 登革热媒介蚊类DNA条形码鉴定方法
SN/T 5106-2019 英文名称: (Dengue vector mosquito DNA barcode identification method)
中华人民共和国出入境检验检疫行业标准
登革热媒介蚊类DNA条形码鉴定方法
中华人民共和国海关总署 发 布
前言
本标准按照GB/T 1.1-2009给出的规则起草。
本标准由中华人民共和国海关总署提出并归口。
本标准起草单位:中华人民共和国福州海关。
本标准起草人:方义亮、张建庆、林醒忠、王宇平、黄恩炯、房长天、吴荣泉。
登革热媒介蚊类DNA条形码鉴定方法
1 范围
本标准规定了登革热媒介蚊类DNA条形码鉴定方法中DNA提取、基因的扩增及序列的比对分
析、结果判定等。
蛹、残肢不全等标本的DNA条形码鉴定。
2 规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本
文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB 19489 实验室 生物安全通用要求
SN/T 1876 医学媒介生物标本采集、制作及保存规程
SN/T 2752.4 卫生检疫人员的自我防护规范 第4部分:实验室人员
SN/T 4278 国境口岸医学媒介昆虫DNA条形码鉴定操作规程
WS/T 230 临床诊断中聚合酶链反应(PCR)技术的应用
3 方法原理
利用通用引物对线粒体DNA中的COI基因的特定片段进行扩增,PCR产物克隆或者直接测序
后,得到长度不少于500bp的有效序列,与本标准的标准序列进行比对,从而达到物种快速准确鉴定的
目的。
4 鉴定程序
4.1 准备
实验室需具备的设备和试剂参见附录 A。实验室生物安全符合GB 19489和SN/T 2752.4的规
定;PCR防污染措施遵照 WS/T 230的要求。
配置电泳液 TAE(1×TAE):将 Tris碱242g,冰醋酸57.1mL,0.5mol/LEDTA(pH8.0)
100mL,定容至1L,用双蒸水稀释50倍。
4.2 标本处理
4.2.1 取样
标本样品经过冷冻或乙醚麻醉,死后取成批同种样品的单份标本、珍稀单份标本取对称一侧组织
(如单侧蚊足)置于灭菌的洁净1.5mL离心管留用,如长期不用需放置体积分数为90%以上乙醇
-20℃保存。标本的其它同种个体或者部分针插作为凭证标本。
4.2.2 凭证标本制作
将取样后的标本制作成凭证标本,标本的制作按照SN/T 1876的要求执行。
4.3 DNA制备
将单份样品(成虫、幼虫、蛹)置于已灭菌的洁净1.5mL离心管后用研磨棒研磨,利用商品化昆虫
DNA提取试剂盒进行蚊虫基因组提取(样品为单只蚊的,需去掉头部后(如有吸血的需要去腹部)后再
研磨);样品为少量对称一侧组织(单侧蚊足)置于已灭菌的洁净1.5mL离心管后用研磨棒研磨,利用
微量组织DAN提取方法(参见附录B)进行蚊虫基因组的制备,制备好的DNA进行浓度及纯度测定
后,保存至-20℃冰箱备用。
4.4 PCR扩增
4.4.1 引物
4.4.2 扩增体系
推荐用50μL体系,可用商品化的PCRmix。验证PCR体系有无污染,可同时设置空白对照和阴性对照;验证PCR反应正常,可设置阳性对照。
TaqPCRMastermix 25μL正反引物(10μM) 各4μL模板(50~100μg/μL) 3μLddH2O 14μL为了提高反应的效果,根据模板的浓度,可以适当增加模板的体积,同时相应减少ddH2O体积,体
系体积不变。
4.4.3 扩增条件
第一步:94℃5min;
第二步:95℃30s,46℃30s,72℃40s,35个循环;
第三步:72℃7min。
4.5 PCR产物检测
4.5.1 琼脂糖凝胶的配置
称取1.5g的琼脂粉倒进盛有100mL1×TAE的烧瓶内,置入微波炉加热使其充分溶解直至透亮
即可。
4.5.2 电泳
取5μLPCR扩增产物(内含有染料),点样于质量浓度为1.5%的琼脂糖凝胶(含有溴化乙锭),电泳缓冲液为1×TAE,在恒压80V电泳30min,用凝胶成像系统成像并拍摄。
4.6 序列测定
COI序列扩增产物电泳条带在750bp左右(参见附录C),具有目的片段电泳条带的扩增产物可委
托专业的测序公司进行双向测定(测序引物同扩增引物),送样具体按照所选公司的要求进行。有条件
的实验室可以选择克隆测序,克隆的流程按SN/T 4278规定执行。
4.......
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