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[PDF] SN/T 5224-2019 - 英文版

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SN/T 5224-2019 229 SN/T 5224-2019 <=3 出口食品中单核细胞增生李斯特氏菌检验方法 实时荧光PCR内标法
基本信息
标准编号 SN/T 5224-2019 (SN/T5224-2019)
中文名称 出口食品中单核细胞增生李斯特氏菌检验方法 实时荧光PCR内标法
英文名称 (Test method for Listeria monocytogenes in exported foods Real-time fluorescent PCR internal standard method)
行业 商检行业标准 (推荐)
中标分类 C53
国际标准分类 67.050
字数估计 10,173
发布日期 2019
实施日期 2020-07-01
发布机构 海关总署

SN/T 5224-2019 Detection of Listeria monocytogenes in food for export-Real-time PCR with internal amplification control method 中华人民共和国出入境检验检疫行业标准 2019-12-27 发布 2020-07-01 实施 中华人民共和国海关总署 发 布 前言 本标准按照 GB/T 1.1-2009 给出的规则起草。 本标准由中华人民共和国海关总署提出并归口。 本标准起草单位:中华人民共和国杭州海关、上海交通大学、中国检验检疫科学研究院。 本标准主要起草人:李可、施春雷、王娉、史贤明、方莹、张晓峰、崔妍。 出口食品中单核细胞增生李斯特菌检验方法 实时荧光 PCR 内标法 1 范围 本标准规定了出口食品中单核细胞增生李斯特菌的实时荧光 PCR 内标方法。 本标准适用于出口食品中单核细胞增生李斯特菌的快速检测。 2 规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文 件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。 GB 4789.30-2016 食品安全国家标准 食品微生物学检验 单核细胞增生李斯特氏菌检验 GB/T 6682 分析实验室用水规格和试验方法 GB 19489 实验室 生物安全通用要求 GB/T 27403 实验室质量控制规范 食品分子生物学检测 3 定义、术语和缩略语 下列定义、术语和缩略语适用于本文件。 3.1 定义和术语 下列术语和定义适用于本文件。 3.1.1 扩增内标 internal amplification control,IAC 添加到 PCR 反应体系中用以指示假阴性现象的一段人工构建 DNA 序列或者是一段致病菌的看家基 因序列。主要原理是:在荧光定量 PCR 中使用与目的基因相似的扩增内标,它的两端引物结合序列与 目的基因完全一致,但具有不同的探针结合序列,使之不能与目的基因的探针结合,只能与内标探针 结合。将扩增内标添加到 PCR 反应体系中,使之与目标基因序列共同进行扩增,如果在反应体系中存 在一些抑制因素,则扩增内标和目标序列的扩增都将受到抑制,从而达到指示 PCR 反应假阴性的目的。 3.1.2 Ct 值 cycle threshold Ct 每个反应管内的荧光信号达到设定的阈值时所经历的循环数。 3.2 缩略语 下列缩略语适用于本文件。 4 方法提要 荧光 PCR 反应体系中,预先加入能同时扩增目标片段和扩增内标的引物,以及目标菌探针、内 标检测探针以及内标质粒,然后将样品 DNA 加入 PCR 反应液中进行两步法荧光 PCR 反应,在扩增 内标质粒与样品 DNA 的共同扩增中如果存在抑制现象,扩增内标的 PCR 扩增也将被抑制,从而达到 对样品的荧光 PCR 检测过程进行假阴性监控目的。 5 试剂 除另有特殊说明外,所有实验用试剂均为分析纯,实验用水符合 GB/T 6682 中一级水的要求。 所有试剂均用无 DNA 酶污染的容器分装。 5.1 DNA 提取试剂:DNA 提取液:20 mmol/L Tris-HCl, 2 mmol/L EDTA,1.2% Triton X-100(pH 8.0),也可使用商业化的 DNA 提取试剂。 5.2 Taq DNA 聚合酶。 5.3 dNTP 混合液。 5.4 10×PCR 缓冲液:200 mmol/L Tris-HCl(pH 8.4),200mmol/L KCl,15 mmol/L MgCl2。 5.5 引物和探针:见附录 A。 5.6 内标质粒:参见附录 B。 6 主要仪器和设备 6.1 恒温水浴锅或加热套装置:100℃。 6.2 恒温培养箱:36℃ ±1℃,30℃ ±1℃。 6.3 离心机:最大转速 13 000 r/min 以上。 6.4 天平:感量 0.1 g。 6.5 冰箱:-20℃ ~4℃。 6.6 均质器。 6.7 可调移液器:1 µL-1000 µL。 6.8 荧光 PCR 仪。 7 检验程序 食品中单核细胞增生李斯特菌的扩增内标荧光 PCR 检测流程见图 1。 图 1 食品中单核细胞增生李斯特菌检验程序 8 操作步骤 8.1  样品制备、增菌培养 按照 GB 4789.30-2016 中第一法进行样品制备和增菌(两次增菌)。 8.2  细菌模板 DNA 的制备 取 8.1 中培养的二次增菌液 1 mL,加到 1.5 mL 无菌离心管中,8 000 r/min 离心 5 min,吸弃上 清液;加入 50 μL DNA 提取液(使用前室温解冻并充分混匀,快速吸取),混匀后沸水浴 10 min,置 冰上 10 min ;12000 r/min 离心 5 min,取上清保存于-20℃备用以待检测。 也可采用等效的商品化 DNA 提取试剂盒并按其说明制备模板 DNA。 8.3  荧光 PCR 检测 8.3.1 荧光 PCR 反应体系 荧光 PCR 反应所用引物和探针见附录 A,PCR 反应体系见表 1。也可采用商品化的 PCR 扩增体系。 每个 DNA 样品做 2 个平行管。加样时应使样品 DNA 溶液完全落入反应液中,不要粘附于壁上,加样 后尽快盖紧管盖。 8.3.2 阳性对照、阴性对照和空白对照设置 检测过程中分别设阳性对照、阴性对照和空白对照。阳性对照采用含有检测序列的 DNA(或质粒) 和 IAC 片段同时作为荧光 PCR 反应的模板,阴性对照采用含 IAC 片段的质粒作为荧光 PCR 反应的模 板,空白对照用无菌水作为荧光 PCR 反应的模板。 8.3.3 荧光 PCR 反应程序 荧光 PCR 反应循环参数为 95℃ 4 min ; 95℃ 5 s,65℃ 20 s,45 个循环。信号采集设为 FAM、 HEX 荧光素(FAM 荧光素代表样品中单核细胞增生李斯特菌信号,HEX 荧光素代表扩增内标信号)。 注:因不同 PCR 仪的性能差异,可通过条件优化适当调整 PCR 循环的退火温度及时间。 9 荧光阈值的确定 PCR 反应完成后应设定荧光阈值以分析样品的 Ct 值,以 PCR 反应的前 3 个 ~15 个循环的荧光信 号作为基线信号(噪音),荧光阈值理论上定义为基线信号的标准偏差的 10 倍,在实际应用中可以根 据仪器基线信号进行人工调整,设定原则是以阈值线刚好超过正常阴性对照样品扩增曲线(无规则的 噪音线)的最高点,且不出现 Ct 值为准。 10 结果及判断 10.1 质控标准 质控标准如下: --空白对照:FAM 荧光素和 HEX 荧光素均无扩增曲线,Ct ≥ 40.0 ; --阴性对照:FAM 荧光素无扩增曲线,Ct ≥ 40.0 ;HEX 荧光素出现典型的扩增曲线,Ct 值应 < 35.0 ; --阳性对照:FAM 荧光素出现典型的扩增曲线,Ct 值应 < 35.0 ; 否则,实验视为无效。 10.2 结果判断 按如下内容进行结果判断: -- Ct 值(FAM)≥ 40.0,可判定样品结果为阴性,可直接报告未检出相应致病菌; -- Ct 值(FAM)≤ 35.0,可判定该样品结果为阳性; -- Ct 值(FAM) >35.0,而 < 40,建议样本重做,再次扩增后的结果 Ct 值如果仍小于 40,并有 典型的扩增曲线,且对照结果均正常,则可判定该基因为阳性。 对于阳性结果,应对样品的二次增菌液或可疑纯菌落进一步按 GB 4789.30 中第一法操作步骤进 行确认后报告结果。 11 生物安全和防污染措施 11.1 生物安全措施 为了保护实验室人员的安全,应由具备资格的工作人员进行操作,所有培养物和废弃物应参照 GB 19489 中的有关规定。 11.2 防污染措施 防污染措施应符合 GB/T 27403 的规定。 附 录 A (规范性附录) 荧光 PCR 所用引物和探针 A.1 单核细胞增生李斯特菌检测所用引物、探针和内标序列检测探针见表 A.1,单核细胞增生李 斯特菌探针 5' 端为 FAM 标记,3' 端为 ECLIPCE 标记,内标序列探针 5' 端为 HEX 标记,3' 端为 ECLIPCE 标记。 B.3 感受态细胞的制备 B.3.1 以无菌接种环取保存的 E.coli TG1 菌株于 LB 琼脂平板划线,37℃培养。 B.3.2 挑取 LB 琼脂平板上的大肠杆菌 TG1 单菌落,接入 5 mL LB 液体培养基中,37℃摇床培养 12 h。 B.3.3 按 1% 接种量将大肠杆菌过夜培养物转接入 50 mL LB 中,37℃摇床培养至 OD600 值约为 0.6, 置于冰中冷却 10 min。 B.3.4 在 4℃,6000 r/min 条件下离心 5 min,倒去上清液,将细胞重悬于预冷的 10 mL 0.1M CaCl2 中, 在冰上放置 20 min 以上。 B.3.5 在 4℃,6000 r/min 条件下离心 5 min,去上清,细胞重新悬浮于 2 mL 预冷的含有 15% 甘油 的 0.1 M CaCl2 中,分装成 100 μL 的小份,于- 70℃保存或直接用于转化。 B.4 连接产物的转化 制备抗性平皿,在装有约 100 μL 感受态细胞的 1.5 mL 离心管中加入连接产物 10 μL,轻轻混匀 于冰上放置 30 min 后,42℃水浴中热击 90 s,热击后迅速置于冰上冷却 2 min。向管中加入 400 μL LB 液。体培养基(不含 Amp),37℃ 200 r/min -220 r/min 振荡培养 1 h, 取 100 μL 菌液涂布合适的抗性 平板,37℃培养 1......

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