路径: 主页 > YY/T > 第26页 > YY/T 1723-2020 | 标准编号 | YY/T 1723-2020 (YY/T1723-2020) | | 中文名称 | 高通量基因测序仪 | | 英文名称 | (High-throughput gene sequencer) | | 行业 | 医药行业标准 (推荐) | | 中标分类 | C30 | | 字数估计 | 11,147 | | 发布日期 | 2020-06-30 | | 实施日期 | 2021-12-01 | | 标准依据 | 国家药品监督管理局公告2020年第76号 | | 发布机构 | 国家药品监督管理局 | YY/T 1723-2020: 高通量基因测序仪
YY/T 1723-2020 英文名称: (High-throughput gene sequencer)
１ 范围
本标准规定了高通量基因测序仪的要求、试验方法、标签和使用说明书、包装、运输和贮存。
本标准适用于半导体测序法、可逆末端终止测序法、联合探针锚定聚合测序法、联合探针锚定连接
测序法、焦磷酸测序等技术为主要技术原理的并行测序高通量基因测序仪。
本标准不适用于桑格（Ｓａｎｇｅｒ）测序为主要技术原理的基因测序仪。
本标准不适用于全内反射显微镜、生物纳米孔、固态纳米孔技术等为主要技术原理的单分子测序的
高通量基因测序仪。
２ 规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件，仅注日期的版本适用于本文
件。凡是不注日期的引用文件，其最新版本（包括所有的修改单）适用于本文件。
GB/T １９１ 包装储运图示标志
GB ４７９３．１ 测量、控制和实验室用电气设备的安全要求 第１部分：通用要求
GB ４７９３．９ 测量、控制和实验室用电气设备的安全要求 第９部分：实验室用分析和其他目的自动和半自动设备的特殊要求
GB/T １４７１０ 医用电器环境要求及试验方法
GB/T １８２６８．１ 测量、控制和实验室用的电设备 电磁兼容性要求 第１部分：通用要求
GB/T １８２６８．２６ 测量、控制和实验室用的电设备 电磁兼容性要求 第２６部分：特殊要求 体外诊断（ＩＶＤ）医疗设备
GB/T ２９７９１．３ 体外诊断医疗器械 制造商提供的信息（标示） 第３部分：专业用体外诊断仪器
ＹＹ０６４８ 测量、控制和实验室用电气设备的安全要求 第２-１０１部分：体外诊断（ＩＶＤ）医用设备
专用要求
３ 术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
３．１
对核酸分子不同碱基类型的测定，即测定组成核酸分子的腺嘌呤（Ａ）、鸟嘌呤（Ｇ）、胞嘧啶（Ｃ）和胸腺嘧啶（Ｔ）或者尿嘧啶（Ｕ）等碱基的组成或排列顺序。
３．２
单次测序可获得序列信息的基因片段数量或可测定的脱氧核糖核酸和核糖核酸（以碱基表示）
数量。
３．３
单次运行质量合格的基因片段数或碱基数。
３．４
单次运行可读取的质量合格的序列片段长度，通常以碱基数表示。
３．５
测序过程中从荧光信号或其他由于测序反应而产生的信号转换成序列信息的过程。
３．６
衡量碱基正确识别的概率。通常以ＡＳＣＩＩ码直接表示。
注：改写GB/T ３０９８９-２０１４，定义３．２９。
３．７
具有明显区别于Ｓａｎｇｅｒ测序的基因测序仪，其特点主要表现在不必预先明确目的片段的引物区序列、基于片段化的ＤＮＡ、依赖于独立反应体系进行克隆扩增、能一次进行对几十万到几百万条核酸序列（ＤＮＡ）分子并行序列测定和读长一般较短等技术特征为标志。
４ 要求
４．１ 外观要求
仪器外观符合如下要求：
---设备表面不应有明显的凹凸、划痕、脱漆、流痕，金属部位不应有锈蚀及机械损伤；
---开关、按键应灵活、可靠，紧固件应紧固、无松动；
---标志、符号应清晰、端正。
４．２ 测序读长和通量
在规定的测序读长模式下，测序通量和测序有效通量应符合制造商规定的要求。
注：测序读长模式根据使用试剂的性能要求进行规定，如双端１５０ｂｐ、单端２００ｂｐ等。
４．３ 碱基识别质量百分比
单次测序，统计碱基识别质量在规定阈值以上的比例，碱基识别质量百分比平均值应不低于制造商
规定的要求。
注：不同原理的测序仪在碱基识别质量表述有差异，如Ｑ２０、Ｑ３０等。
４．４ 性能指标
４．４．１．１ 测序覆盖率和测序平均深度
制造商应规定检测国家参考品或标准品的测序覆盖率和测序平均深度。
４．４．１．２ 测序准确率
在制造商规定的测序覆盖率和测序平均深度下，符合以下要求：
ａ） 检测人基因组（ＤＮＡ）参考品或标准品，比对率应符合制造商的要求，与单碱基变异（ＳＮＰ）、插入缺失变异（Ｉｎｄｅｌ）参考数据集比较，ＳＮＰ、Ｉｎｄｅｌ的准确率和灵敏度应符合制造商的要求；
ｂ） 检测人基因组ＤＮＡ参考品或标准品，比对率应符合制造商的要求，与人基因组ＤＮＡ参考序列中指定１Ｇｂ参考序列比对，测序一致序列准确率应不低于９９．０％；
ｃ） 检测细菌和病毒ＤＮＡ参考品，与对应参考序列比对，测序一致序列准确率应不低于９９．０％。
注１：对限定只用于人基因组ＤＮＡ检测的基因测序仪可只进行人基因组ＤＮＡ参考品或标准品检测，即进行ａ）和ｂ）的检测。
注２：对限定只用于病原微生物检测的基因测序仪可只进行细菌和病毒ＤＮＡ参考品检测，即进行ｃ）的检测。
注３：对进行单链序列分析的基因测序仪可增加单倍型基因组ＤＮＡ参考品的检测指标。
４．４．１．３ 重复性
进行３次重复测序，均能符合４．４．１．１和４．４．１．２的要求。
４．４．２．１ 测序覆盖率和测序平均深度
制造商应规定检测国家参考品或标准品的测序覆盖率和测序平均深度。
４．４．２．２ 测序准确率
在制造商规定的测序覆盖率和测序平均深度下，符合以下要求：
ａ） 检测人基因组ＤＮＡ参考品或标准品中指定的全外显子区域，比对率应符合制造商的要求，与指定全外显子区域ＳＮＰ、Ｉｎｄｅｌ参考数据集比较，ＳＮＰ、Ｉｎｄｅｌ的准确率和灵敏度应符合制造商的要求；
ｂ） 检测人基因组ＤＮＡ参考品或标准品中指定的全外显子区域，比对率应符合制造商的要求，与人基因组ＤＮＡ参考序列中指定的全外显子区域比对，测序一致序列准确率应不低于９９．０％；
ｃ） 检测细菌和病毒ＤＮＡ参考品，与对应参考序列比对，测序一致序列准确率应不低于９９．０％。
注１：对限定只用于人基因组ＤＮＡ检测的基因测序仪可只进行人基因组ＤＮＡ参考品或标准品检测，即进行ａ）和ｂ）的检测。
注２：对限定只用于病原微生物检测的基因测序仪可只进行细菌和病毒ＤＮＡ参考品检测，即进行ｃ）的检测。
注３：对进行单链序列分析的基因测序仪可增加单倍型基因组ＤＮＡ参考品的检测指标。
４．４．２．３ 重复性
进行３次重复测序，应均能符合４．４．２．１和４．４．２．２的要求。
４．４．３．１ 测序覆盖率和测序平均深度
制造商应规定检测国家参考品或标准品的测序覆盖率和测序平均深度。
４．４．３．２ 测序准确率
在制造商规定的测序覆盖率和测序平均深度下，符合以下要求：
ａ） 检测人基因组ＤＮＡ参考品或标准品中指定的１７Ｋｂ区域，比对率应符合制造商的要求，与指定１７Ｋｂ区域中指定的１０个ＳＮＰ位点，ＳＮＰ检测的准确率应不低于９０％；
ｂ） 检测人基因组ＤＮＡ参考品或标准品中指定的１７Ｋｂ区域序列比对，测序一致序列准确率应不低于９９．０％；
ｃ） 检测细菌和病毒ＤＮＡ参考品，与对应参考序列比对，测序一致序列准确率应不低于９９．０％。
注１：对限定只用于人基因组ＤＮＡ检测的基因测序仪可只进行人基因组ＤＮＡ参考品或标准品检测，即进行ａ）和ｂ）的检测。
注２：对限定只用于病原微生物检测的基因测序仪可只进行细菌和病毒ＤＮＡ参考品检测，即进行ｃ）的检测。
注３：对进行单链序列分析的基因测序仪可增加单倍型基因组ＤＮＡ参考品的检测指标。
４．４．３．３ 重复性
进行３次重复测序，应均能符合４．４．３．１和４．４．３．２的要求。
４．５ 软件功能
高通量基因测序仪软件功能应至少包含仪器运行控制功能和信号实时采集功能两部分：
ａ） 仪器运行控制软件应能引导完成仪器运行和控制，并符合制造商的要求；
ｂ） 信号实时采集软件应能完成测序信号提取和处理，并符合制造商的要求。
４．６ 安全要求
应符合GB ４７９３．９、ＹＹ０６４８和GB ４７９３．１中相关规定。
４．７ 电磁兼容性要求
应符合GB/T １８２６８．１和GB/T １８２６８．２６中相关规定。
４．８ 环境试验要求
应符合GB/T １４７１０中相关规定。
５ 试验方法
５．１ 外观
在自然光下，目测检查高通量基因测序仪外观，应符合４．１的要求。
５．２ 测序读长和通量
按照各测序仪厂商提供的测序样品制备流程和测序操作进行待测样品处理、质控和测序，待测序反
应完成后，测序仪使用测序信号收集器（根据标记信号的不同选用不同的收集器，如图像信号收集器中的高精度ＣＭＯＳ，电信号收集器中的半导体传感器，光谱信号收集器中的光谱成像仪等），对测序信号完成搜集。再通过信号分析软件，对采集得到的信号进行分析，将信号图转变成核苷酸序列信息。通常以序列数表示。单末端或双末端测序产生的一条序列信息，计为一条序列数。
根据测序通量所得到的序列数，......
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