路径: 主页 > GB/T > 第732页 > GB/T 46927-2025 | 标准编号 | GB/T 46927-2025 (GB/T46927-2025) | | 中文名称 | 时空组学 数据集格式规范 | | 英文名称 | Spatio-temporal omics - Specification for dataset format | | 行业 | 国家标准 (推荐) | | 中标分类 | A40 | | 国际标准分类 | 07.080 | | 字数估计 | 38,332 | | 发布日期 | 2025-12-31 | | 实施日期 | 2026-07-01 | | 发布机构 | 国家市场监督管理总局、国家标准化管理委员会 | GB/T 46927-2025: 时空组学 数据集格式规范
ICS 07.080
CCSA40
中华人民共和国国家标准
时空组学 数据集格式规范
2025-12-31发布
2026-07-01实施
国 家 市 场 监 督 管 理 总 局
国 家 标 准 化 管 理 委 员 会 发 布
目次
前言 Ⅲ
1 范围 1
2 规范性引用文件 1
3 术语和定义 1
4 缩略语 4
5 时空组学元数据要求 5
6 时空组学数据集文件要求 5
6.1 通则 5
6.2 高通量测序数据 5
6.3 显微图像 5
6.4 时空芯片基因表达矩阵数据 5
6.5 时空芯片基因表达热图数据 6
6.6 时空组学图像处理参数文件 6
6.7 已配准图像金字塔数据 6
7 时空组学数据存储目录要求 6
7.1 总则 6
7.2 目录结构说明 7
7.3 编码规则 8
附录A(资料性) 时空组学元数据 9
A.1 概述 9
A.2 字段必选性说明 9
A.3 时空组学数据集元数据表 9
A.4 时空组学生物信息分析环境元数据表 11
A.5 元数据提供方式 12
附录B(资料性) 时空芯片基因表达矩阵数据 13
B.1 概述 13
B.2 数据结构 13
B.3 示例 15
B.4 约束与解析规则 15
附录C(资料性) 时空芯片基因表达热图数据 16
C.1 概述 16
C.2 时空芯片基因表达热图数据的文件结构 16
附录D(资料性) 时空组学图像处理参数文件 24
D.1 概述 24
D.2 时空组学图像处理参数文件的数据结构 24
附录E(资料性) 已配准图像金字塔数据 26
E.1 概述 26
E.2 已配准图像金字塔数据文件结构详解 26
参考文献 31
前言
本文件按照GB/T 1.1-2020《标准化工作导则 第1部分:标准化文件的结构和起草规则》的规定
起草。
请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别专利的责任。
本文件由全国生化检测标准化技术委员会(SAC/TC387)提出并归口。
本文件起草单位:深圳华大生命科学研究院、中国测试技术研究院、武汉华大生命科学研究院、之江
实验室、西南华大生命科学研究院、深圳赛陆医疗科技有限公司、深圳大学、菁良科技(深圳)有限公司、
鹏城实验室、北京诺禾致源科技股份有限公司、苏州百源基因技术有限公司、利德健康科技(广州)有限
公司。
本文件主要起草人:陈毓新、周李华、张楠、王乐颖、张勇、李胜康、冯琳清、杜玥、谢敏、徐讯、黎宇翔、
徐枣旭、吴边、朱泽轩、林木飞、李菁华、宝力格、王荣杰、车团结、张峰、车妍。
时空组学 数据集格式规范
1 范围
本文件规定了时空组学数据集的存储及格式要求,包括时空组学的元数据、数据集文件及数据存储
目录。
本文件适用于时空组学数据的存储与共享。
2 规范性引用文件
下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中,注日期的引用文
件,仅该日期对应的版本适用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于
本文件。
GB/T 29859-2013 生物信息学术语
GB/T 35890-2018 高通量测序数据序列格式规范
3 术语和定义
GB/T 29859-2013界定的以及下列术语和定义适用于本文件。
3.1
时空组学 spatio-temporalomics
在空间转录组学的基础上,扩展至基因组学、表观基因组学、蛋白质组学等多组学层面,利用空间分
辨的多组学技术对组织或生命体进行单细胞或亚细胞分辨率的分子定位,并结合时间序列采样或计算
推断,实现对发育、生理、病理等生物过程的时空动态解析。
注:空间转录组学是指在组织或器官的空间背景下,利用高通量技术在单细胞或亚细胞分辨率上定位转录本表
达,从而在分子、细胞、组织、器官等多尺度范围内实现空间观测。
3.2
能够捕获生物分子的最小空间单元。
注:在此单元区域内捕获的生物分子的空间位置无法进行区分。
3.3
时空芯片 spatio-temporalchip
将生物分子捕获单元以一定模式排列,用于捕获空间中核酸片段的专用芯片。
注:芯片上所有的生物分子捕......
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