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[PDF] SN/T 5106-2019 - 英文版

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SN/T 5106-2019 英文版 279 SN/T 5106-2019 [PDF]天数 >=3 登革热媒介蚊类DNA条形码鉴定方法 有效
基本信息
标准编号 SN/T 5106-2019 (SN/T5106-2019)
中文名称 登革热媒介蚊类DNA条形码鉴定方法
英文名称 (Dengue vector mosquito DNA barcode identification method)
行业 商检行业标准 (推荐)
中标分类 C62
国际标准分类
字数估计 13,128
发布日期 2019-09-03
实施日期 2020-03-01
标准依据 海关总署公告2019年第142号
发布机构 海关总署

SN/T 5106-2019: 登革热媒介蚊类DNA条形码鉴定方法 SN/T 5106-2019 英文名称: (Dengue vector mosquito DNA barcode identification method) 中华人民共和国出入境检验检疫行业标准 登革热媒介蚊类DNA条形码鉴定方法 中华人民共和国海关总署 发 布 前言 本标准按照GB/T 1.1-2009给出的规则起草。 本标准由中华人民共和国海关总署提出并归口。 本标准起草单位:中华人民共和国福州海关。 本标准起草人:方义亮、张建庆、林醒忠、王宇平、黄恩炯、房长天、吴荣泉。 登革热媒介蚊类DNA条形码鉴定方法 1 范围 本标准规定了登革热媒介蚊类DNA条形码鉴定方法中DNA提取、基因的扩增及序列的比对分 析、结果判定等。 蛹、残肢不全等标本的DNA条形码鉴定。 2 规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本 文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。 GB 19489 实验室 生物安全通用要求 SN/T 1876 医学媒介生物标本采集、制作及保存规程 SN/T 2752.4 卫生检疫人员的自我防护规范 第4部分:实验室人员 SN/T 4278 国境口岸医学媒介昆虫DNA条形码鉴定操作规程 WS/T 230 临床诊断中聚合酶链反应(PCR)技术的应用 3 方法原理 利用通用引物对线粒体DNA中的COI基因的特定片段进行扩增,PCR产物克隆或者直接测序 后,得到长度不少于500bp的有效序列,与本标准的标准序列进行比对,从而达到物种快速准确鉴定的 目的。 4 鉴定程序 4.1 准备 实验室需具备的设备和试剂参见附录 A。实验室生物安全符合GB 19489和SN/T 2752.4的规 定;PCR防污染措施遵照 WS/T 230的要求。 配置电泳液 TAE(1×TAE):将 Tris碱242g,冰醋酸57.1mL,0.5mol/LEDTA(pH8.0) 100mL,定容至1L,用双蒸水稀释50倍。 4.2 标本处理 4.2.1 取样 标本样品经过冷冻或乙醚麻醉,死后取成批同种样品的单份标本、珍稀单份标本取对称一侧组织 (如单侧蚊足)置于灭菌的洁净1.5mL离心管留用,如长期不用需放置体积分数为90%以上乙醇 -20℃保存。标本的其它同种个体或者部分针插作为凭证标本。 4.2.2 凭证标本制作 将取样后的标本制作成凭证标本,标本的制作按照SN/T 1876的要求执行。 4.3 DNA制备 将单份样品(成虫、幼虫、蛹)置于已灭菌的洁净1.5mL离心管后用研磨棒研磨,利用商品化昆虫 DNA提取试剂盒进行蚊虫基因组提取(样品为单只蚊的,需去掉头部后(如有吸血的需要去腹部)后再 研磨);样品为少量对称一侧组织(单侧蚊足)置于已灭菌的洁净1.5mL离心管后用研磨棒研磨,利用 微量组织DAN提取方法(参见附录B)进行蚊虫基因组的制备,制备好的DNA进行浓度及纯度测定 后,保存至-20℃冰箱备用。 4.4 PCR扩增 4.4.1 引物 4.4.2 扩增体系 推荐用50μL体系,可用商品化的PCRmix。验证PCR体系有无污染,可同时设置空白对照和阴性对照;验证PCR反应正常,可设置阳性对照。 TaqPCRMastermix  25μL正反引物(10μM) 各4μL模板(50~100μg/μL) 3μLddH2O 14μL为了提高反应的效果,根据模板的浓度,可以适当增加模板的体积,同时相应减少ddH2O体积,体 系体积不变。 4.4.3 扩增条件 第一步:94℃5min; 第二步:95℃30s,46℃30s,72℃40s,35个循环; 第三步:72℃7min。 4.5 PCR产物检测 4.5.1 琼脂糖凝胶的配置 称取1.5g的琼脂粉倒进盛有100mL1×TAE的烧瓶内,置入微波炉加热使其充分溶解直至透亮 即可。 4.5.2 电泳 取5μLPCR扩增产物(内含有染料),点样于质量浓度为1.5%的琼脂糖凝胶(含有溴化乙锭),电泳缓冲液为1×TAE,在恒压80V电泳30min,用凝胶成像系统成像并拍摄。 4.6 序列测定 COI序列扩增产物电泳条带在750bp左右(参见附录C),具有目的片段电泳条带的扩增产物可委 托专业的测序公司进行双向测定(测序引物同扩增引物),送样具体按照所选公司的要求进行。有条件 的实验室可以选择克隆测序,克隆的流程按SN/T 4278规定执行。 4.......

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