SN/T 5108-2019 相关标准英文版PDF
| 标准号码 | 价格美元 | 第2步(购买) | 交付天数 | 标准名称 |
| SN/T 5108-2019 | 179 | SN/T 5108-2019 | [PDF]天数 <=3 | 国境口岸轮状病毒、星状病毒、诺如病毒、札如病毒四联HRMA检测方法 |
| 基本信息 | |
|---|---|
| 标准编号 | SN/T 5108-2019 (SN/T5108-2019) |
| 中文名称 | 国境口岸轮状病毒、星状病毒、诺如病毒、札如病毒四联HRMA检测方法 |
| 英文名称 | (Method for detecting HRMA of rotavirus, astrovirus, norovirus and Zaru virus in border port) |
| 行业 | 商检行业标准 (推荐) |
| 中标分类 | C62 |
| 国际标准分类 | |
| 字数估计 | 8,818 |
| 发布日期 | 2019-09-03 |
| 实施日期 | 2020-03-01 |
| 标准依据 | 海关总署公告2019年第142号 |
| 发布机构 | 海关总署 |
SN/T 5108-2019: 国境口岸轮状病毒、星状病毒、诺如病毒、札如病毒四联HRMA检测方法
SN/T 5108-2019 英文名称: (Method for detecting HRMA of rotavirus, astrovirus, norovirus and Zaru virus in border port)
中华人民共和国出入境检验检疫行业标准
国境口岸轮状病毒、星状病毒、诺如病毒、
札如病毒四联HRMA检测方法
中华人民共和国海关总署 发 布
前言
本标准按照GB/T 1.1-2009给出的规则起草。
本标准由中华人民共和国海关总署提出并归口。
本标准起草单位:中华人民共和国拱北海关,深圳市计量质量检测研究院。
本标准主要起草人:汪海波、莫秋华、杨泽、兰全学、杨国武、史咏梅、涂承宁、林继灿。
国境口岸轮状病毒、星状病毒、
诺如病毒、札如病毒四联HRMA检测方法
1 范围
本标准规定了国境口岸轮状病毒、星状病毒、诺如病毒和札如病毒这四种病毒的检验对象、方法、结
果报告、生物安全要求及阳性结果判定。
本标准适用于入出境人员携带轮状病毒、星状病毒、诺如病毒、札如病毒的实验室检测。
2 规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文
件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB 19489 实验室生物安全通用要求
WS/T 230 临床诊断中聚合酶链反应(PCR)技术的应用
SN/T 1193 基因检验实验室技术要求
SN/T 1720 出入境口岸轮状病毒感染监测规程
人间传染的病原微生物名录(中华人民共和国卫生部2006年制定)
4 缩略语
下列缩略语适用于本文件:
---bp:basepair,碱基对;
---DEPC:diethylpyrocarbonate,焦碳酸乙二酯;
---HRMA:highresolutionmeltinganalysis,高分辨率熔解曲线分析;
---PAGE:polyacrylamidegelelectrophoresis,聚丙烯酰胺凝胶电泳。
5 检测对象
5.1 出入境口岸发现的有呕吐、腹泻和发热等症状疑似腹泻病毒感染的急性肠胃炎病人。
5.2 其他申请检验的人员。
6 生物安全和PCR防污染要求
实验室生物安全应符合GB 19489的规定。按照《人间传染的病原微生物名录》,这四种病毒的危
害程度均为第三类,可在生物安全二级实验室进行相关操作。PCR 防污染措施按 WS/T 230和
SN/T 1193的规定执行。
7 主要仪器
本方法所用的主要仪器如下:
---二级生物安全柜;
---台式高速冷冻离心机(最高离心力12000rpm以上);
---旋涡振荡器;
---冰箱:4℃、-20℃和-70℃;
---超净工作台;
---微型离心机;
---Rotor-GeneQPCR热循环仪(带高分辨率熔解曲线分析模块);
注:给出这一信息是为了方便本标准的使用者,并不表示对该产品的认可和推荐。如果其他等效产品具有相同的
效果,则可使用这些等效产品。
---微波炉;
---高压灭菌锅;
---超纯水器或双蒸水器;
---微量可调移液器一套(含以下5种规格:2.5μL、20μL、100μL、200μL、1mL)。
8 主要试剂
8.1 无RNA酶的DEPC水。
8.2 RT-PCR引物应为PAGE以上级别纯化,引物序列见9.2.3.1。
8.3 RT-PCR基础试剂:宝生物工程(大连)有限公司PrimeScriptOneStepRT-PCRKit。
注:给出这一信息是为了方便本标准的使用者,并不表示对该产品的认可和推荐。如果其他等效产品具有相同的
效果,则可使用这些等效产品。
8.4 EvaGreen荧光染料。
9 检验程序
9.1 样品采集
粪便标本和呕吐物标本的采集按照SN/T 1720执行。
9.2 实验室检验
9.2.1 样品预处理
取黄豆大小约100mg的粪便标本或呕吐物,或100μL水样便,加入900μL的生理盐水,剧烈振荡混匀,制成10%的悬液;然后4℃,8000r/min离心5min;转移上清至灭菌的干净离心管。不能立即
进行检测时,样本冻存于-70℃超低温冰箱备用。
9.2.2 病毒核酸提取
取9.2.1预处理好的样本100μL,加入1mLTrizol液,振荡混匀后室温静置5min,然后加入200μL氯仿,盖紧离心管,用手剧烈振荡混匀15sec后室温静置5min,4℃,12000r/min离心10min,取上层水相至另一离心管中,加入500μL 异丙醇沉淀 RNA,充分混匀后室温放置 10 min,12000r/min离心10min,弃上清液,再加入1mL的70%乙醇洗涤一次,12000r/min离心5min,弃
上清液,室温放置5min~10min后加入50μLDEPC水(或其他核酸溶解液)溶解核酸沉淀,分装后于-70℃条件下保存,备用。
9.2.2.2 试剂盒提取核酸法
按适用于病毒基因组提取的商品试剂盒说明书操作。
9.2.3 四重高分辨率熔解曲线检测
9.2.3.1 引物
引物序列分别见表1。
9.2.3.2 标准品、阳性对照、阴性对照和空白对照设置
检测过程中分别设标准品、阳性对照、阴性对照和空白对照。标准品为克隆的轮状病毒、星状病毒、
诺如病毒和札如病毒部分核苷酸序列(必须包含扩增区域在内)在体外转录合成的RNA;阳性对照为留
存的这4种病毒的阳性样本的核酸或体外转录合成的RNA;阴性对照为正常人大便提取的核酸;空白
对照为无菌水。
9.2.3.3 反应体系组成
反应体系组成见表2。
9.2.3.4 反应条件
反应条件为:42℃ 反转录5min;95℃预变性10sec;95℃变性10sec,60℃退火/延伸30sec,40
个循环;设置温度从65℃逐渐上升至95℃,上升速率为0.1℃/cycle。因不同PCR仪器的性能差异,
可根据条件优化适当调整反应条件。
9.2.3.5 高分辨率熔解曲线分析
用仪器自带的软件对生成的熔解曲线进行分析,将阳性对照/阴性对照/空白对照/样本的熔解曲线
同标准品的熔解曲线进行对比。阳性样本的曲线为典型的单一尖峰,而阴性样本的曲线为均一直线,无
熔解峰。
9.2.4 检验结果判断及报告
当阳性对照的熔解曲线同各标准品的一致,而阴性对照/空白对照的为均一直线时才可对样本进行
结果判断及报告,否则视为实验失败,需重新实验。本标准检验结果判断及报告如下:
a) 检验样品的熔解曲线同轮状病毒标准品的一致,报告“检出轮状病毒特异性基因(HRMA
法)”;
b) 检验样品的熔解曲线同星状病毒标准品的一致,报告“检出星状病......