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| 标准编号 | GB/T 40226-2021 (GB/T40226-2021) | | 中文名称 | | | 英文名称 | Detection of environmental microbial metagenome - High throughput sequencing | | 行业 | 国家标准 (推荐) | | 中标分类 | A40 | | 字数估计 | 18,146 | | 发布机构 | 国家市场监督管理总局、中国国家标准化管理委员会 | GB/T 40226-2021
Detection of environmental microbial metagenome - High throughput sequencing
ICS 07.080
CCSA40
中华人民共和国国家标准
环境微生物宏基因组检测 高通量测序法
2021-05-21发布
2021-12-01实施
国 家 市 场 监 督 管 理 总 局
国 家 标 准 化 管 理 委 员 会 发 布
目次
前言 Ⅲ
1 范围 1
2 规范性引用文件 1
3 术语和定义 1
4 缩略语 2
5 原理 2
6 试验条件 2
7 试剂 2
8 仪器设备 2
9 样品 3
10 试验步骤 3
11 试验报告 4
12 质量控制 5
附录A(规范性) 粪便样品采集、保存、运输方法 6
附录B(规范性) 土壤样品采集、保存、运输方法 7
附录C(规范性) 水体样品采集、保存、运输方法 8
附录D(资料性) 样品信息单 9
附录E(资料性) DNA样品的完整性图谱和质量级别分类 10
附录F(资料性) 参考数据库 11
参考文献 12
前言
本文件按照GB/T 1.1-2020《标准化工作导则 第1部分:标准化文件的结构和起草规则》的规定
起草。
请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别专利的责任。
本文件由全国生化检测标准化技术委员会(SAC/TC387)提出并归口。
本文件起草单位:深圳华大生命科学研究院、深圳华大基因科技有限公司、深圳市生命科技产学研
资联盟、中国测试技术研究院生物研究所、深圳华大临床检验中心。
本文件主要起草人:陈冰、肖亮、钟焕姿、李俊桦、李倩一、贾慧珏、姜华艳、周李华、唐美芳、吴昊、
李陶莎、周媛、钟宏彬。
环境微生物宏基因组检测 高通量测序法
1 范围
本文件描述了采用高通量测序技术进行环境微生物宏基因组检测的术语和定义、原理、试验条件、
试剂、仪器设备、样品、试验步骤、试验报告和质量控制要求。
本文件适用于运用高通量测序法进行环境微生物宏基因组的检测。
2 规范性引用文件
下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中,注日期的引用文
件,仅该日期对应的版本适用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于
本文件。
GB/T 6682 分析试验室用水规格和试验方法
GB 19489 实验室 生物安全通用要求
GB/T 35537-2017 高通量基因测序结果评价要求
3 术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
3.1
环境 environment
相对某项中心事物的周围世界。
注:在本文件中特指人体(动物)环境与自然环境。人体(动物)环境包括但不限于口腔、皮肤、生殖道、肠道等;自然
环境包括但不限于空气、水体、土壤、沉积物等。
3.2
相对丰度 relativeabundance
某一特定种类微生物在环境微生物群落中所占的相对比例。
注:通常以百分比表示。
3.3
微生物宏基因组 microbialmetagenome
以特定环境中整个微生物群落作为研究对象,不分离培养,直接提取得到的所有微生物基因
组DNA。
注:可用于分析其遗传信息、物种分类、系统进化、基因功能及代谢网络等。
3.4
碱基识别质量 quality......
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