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| 标准编号 | LY/T 2896-2017 (LY/T2896-2017) | | 中文名称 | 大熊猫种群遗传档案建立技术规程 | | 英文名称 | A regulation for giant panda population genetic archives | | 行业 | 林业行业标准 (推荐) | | 中标分类 | B65 | | 国际标准分类 | 65.020 | | 字数估计 | 18,126 | | 发布日期 | 2017-10-27 | | 实施日期 | 2018-01-01 | | 标准依据 | 国家林业局公告2017年第18号;行业标准备案公告2017年第12号(总第216号) | | 发布机构 | 国家林业局 | LY/T 2896-2017
A regulation for giant panda population genetic archives
ICS 65.020
B65
中华人民共和国林业行业标准
大熊猫种群遗传档案建立技术规程
2017-10-27发布
2018-01-01实施
国 家 林 业 局 发 布
目次
前言 Ⅲ
1 范围 1
2 术语和定义 1
3 采样频次、时间和路线 1
3.1 采样频次与时间 1
3.2 采样路线 1
4 样品的采集和保存方法 1
4.1 采样工具 1
4.2 粪便新鲜程度的判定 2
4.3 粪便样品的选取原则 2
4.4 样品采集方法 2
4.5 样品记录与编号 2
4.6 样品的临时保存 2
4.7 样品的运输和实验室保存 3
5 样品DNA的提取和保存方法 3
5.1 粪便样品的DNA提取 3
5.2 DNA的保存 3
6 遗传标记选用原则 3
6.1 线粒体标记 3
6.2 性别鉴定分子标记 3
6.3 微卫星标记 3
7 实验流程 4
7.1 DNA质量检测和线粒体标记PCR扩增 4
7.2 个体识别 4
7.3 性别鉴定 4
7.4 遗传多样性评估 4
8 线粒体标记PCR扩增方法 4
8.1 引物合成 4
8.2 PCR扩增体系及程序 4
9 大熊猫性别鉴定PCR方法 5
9.1 PCR扩增引物的合成 5
9.2 PCR扩增体系及程序 5
9.3 电泳检测 5
9.4 性别判读 5
10 微卫星标记PCR扩增方法 5
10.1 PCR引物的设计、合成与荧光标记 5
10.2 PCR扩增的反应体系和扩增程序 5
10.3 PCR产物的质量检测 6
10.4 微卫星分型 6
10.5 微卫星分型数据的应用 6
11 种群遗传档案的内容 6
11.1 采样数据 6
11.2 线粒体标记测序数据 6
11.3 性别鉴定数据 6
11.4 微卫星标记分型数据 6
11.5 研究报告 6
12 遗传档案数据的管理和使用 7
附录A(规范性附录) 大熊猫粪便样品采集记录表 8
附录B(规范性附录) 大熊猫微卫星标记编号、名称、核心序列及来源 9
附录C(规范性附录) 大熊猫微卫星标记名称、PCR扩增引物及扩增长度 10
前言
本标准按照GB/T 1.1-2009给出的规则起草。
本标准由国家林业局保护司提出并归口。
本标准起草单位:四川大学、中国科学院动物研究所、中国大熊猫保护研究中心、成都大熊猫繁育研
究基地、四川省野生动物资源调查保护管理站。
本标准主要起草人:岳碧松、魏辅文、李德生、沈富军、杨旭煜、古晓东、张玲、陈浩。
大熊猫种群遗传档案建立技术规程
1 范围
本标准规定了大熊猫样品采集保存、DNA提取、性别鉴定、个体识别、遗传多样性评估和种群遗传
档案建立的技术和方法。
本标准适用于圈养大熊猫和野生大熊猫。
2 术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
2.1
基因组中由1个~6个核苷酸为基本重复单元组成的DNA串联重复序列,例如(AC)n、(ACG)n、
(ATTT)n等,也称短串联重复序列(shorttandemrepeats,STR)或简单重复序列(simplesequences
2.2
DNA样品 DNAsamples
利用大熊猫组织(如毛发、血液、精液、肌肉组织等)或新鲜粪便提取的大熊猫基因组DNA。
3 采样频次、时间和路线
3.1 采样频次与时间
野生大熊猫样品的采集可结合保护区监测和巡护等日常工作常年进行。
野生大熊猫样品大规模集中采样可在春季化雪后(繁殖季节)和冬季积雪前(非繁殖季节)开展;对
于交通比较方便的大熊猫分布密集区,可以根据具体情况和工作目标增加采样次数。各地可根据当地
大熊猫的习性以及当地的物候、气候、大熊猫主食竹发笋规律、野外工作条件和后勤保障等因素,确定具
体采样时间。野外采样工作应尽量在最短时间内完成,一般为10d~20d。
圈养大熊猫样品可以结合日常工作随时采集。
3.2 采样路线
样品的大规模集中采集路线以全国第四次大熊......
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