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SN/T 4877.15-2019 相关标准英文版PDF

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SN/T 4877.15-2019 英文版 259 SN/T 4877.15-2019 [PDF]天数 <=3 基因条形码筛查方法 第15部分:检疫性叶点霉 SN/T 4877.15-2019 有效
基本信息
标准编号 SN/T 4877.15-2019 (SN/T4877.15-2019)
中文名称 基因条形码筛查方法 第15部分:检疫性叶点霉
英文名称 (Gene barcode screening methods - Part 15: Phytophthora)
行业 商检行业标准 (推荐)
中标分类 C62
国际标准分类
字数估计 12,113
发布日期 2019-09-03
实施日期 2020-03-01
标准依据 海关总署公告2019年第142号
发布机构 海关总署

SN/T 4877.15-2019: 基因条形码筛查方法 第15部分:检疫性叶点霉 SN/T 4877.15-2019 英文名称: (Gene barcode screening methods - Part 15: Phytophthora) 中华人民共和国出入境检验检疫行业标准 SN/T4877.15-2019 基因条形码筛查方法 第15部分:检疫性叶点霉 中华人民共和国海关总署 发 布 前言 本部分依据GB/T 1.1-2009给出的规则起草。 本部分由中华人民共和国海关总署提出并归口。 本部分起草单位:宁波检验检疫科学技术研究院、中华人民共和国宁波海关、中国科学院微生物研 究所、中国检验检疫科学研究院。 本部分主要起草人:段维军、蔡磊、郭立新、陈倩、段丽君、李雪莲、刘芳、赵文军、陈先锋。 SN/T4877.15-2019 SN/T 4877《基因条形码筛查方法》分为15个部分: - - 第 1 部 分 : 检 疫 性 棒 形 杆 菌 ; - - 第 2 部 分 : 检 疫 性 黄 单 胞 菌 ; - - 第 3 部 分 : 检 疫 性 植 原 体 ; - - 第 4 部 分 : 检 疫 性 茎 点 霉 ; - - 第 5 部 分 : 检 疫 性 拟 茎 点 霉 ; - - 第 6 部 分 : 检 疫 性 嗜 酸 菌 ; - - 第 7 部 分 : 检 疫 性 轮 枝 菌 ; - - 第 8 部 分 : 检 疫 性 炭 疽 菌 ; - - 第 9 部 分 : 检 疫 性 腥 黑 粉 菌 ; - - 第 1 0 部 分 : 检 疫 性 疫 霉 ; - - 第 1 1 部 分 : 检 疫 性 异 株 苋 亚 属 ; - - 第 1 2 部 分 : 黄 瓜 绿 斑 驳 花 叶 病 毒 ; - - 第 1 3 部 分 : 检 疫 性 马 铃 薯 Y 病 毒 属 病 毒 ; - - 第 1 4 部 分 : 检 疫 性 南 方 菜 豆 花 叶 病 毒 属 病 毒 ; - - 第 1 5 部 分 : 检 疫 性 叶 点 霉 。 本 部 分 为 SN/T 4877的 第 1 5 部 分 。 基因条形码筛查方法 第15部分:检疫性叶点霉 1 范围 本部分规定了检疫性叶点霉DNA条形码筛查方法。 本部分适用于进境植物及其产品中检疫性叶点霉的筛查。 2 规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文 件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。 SN/T 2589 植物病原真菌检测规范 3 术语和定义 下列术语和定义适用于本文件。 3.1 检疫性叶点霉属真菌 凭证标本是一种为鉴定或研究提供实物依据并具有足够存档信息(采集及鉴定信息等)而长期保存 的标本,它可以是完整的生物个体或其一部分,也可以是生物体的遗传物质。凭证标本的保存需要有详 细的标本编号、存放地点等详细信息,以便于日后查证。 DNA条形码是指生物体内能够代表该物种的,标准的、有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA 片段。研究人员用DNA条形码技术鉴定物种及物种间亲缘关系,修改已有的分类学结论等。 用于鉴定检疫性叶点霉属的DNA条形码如下: 4 方法原理 根据叶点霉属真菌的核糖体转录间隔区(ITS)的序列特征,应用DNA条形码技术对检疫性叶点霉 进行种类筛查,确定目标真菌是否为检疫性叶点霉及其种属归类。 5 仪器用具和试剂 5.1 仪器设备与用具 显微镜、高压灭菌锅、超净工作台、组织破碎仪、恒温水浴锅、台式冷冻离心机、微量分光光度仪、电 子天平、超纯水仪、漩涡振荡器、冰箱、微量移液器(0.5μL,2.5μL,10μL,20μL,200μL,1000μL)、常规PCR仪、核酸电泳仪、凝胶成像系统、DNA提取仪。 5.2 主要试剂 购置如下试剂或者相应的真菌基因组提取试剂盒:乙二胺四乙酸钠盐(Na2EDTA·2H2O)、氢氧 化钠(NaOH)、Tris碱、浓盐酸(HCl)、溴化十六烷基三甲铵(CTAB)、氯化钠(NaCl)、聚乙烯吡咯烷酮 (PVP)、冰醋酸(CH3COOH)、蒸馏水、氯仿(CHCl3)、异戊醇、70%乙醇。 PCR和电泳检测所需试剂:10×PCR缓冲液、脱氧核糖核苷三磷酸(dNTPs)、ExTaq聚合酶、引 物、超纯水、DL2000Marker、琼脂糖、GelRed核酸凝胶染料。 6 筛查鉴定方法 6.1 样品的采集与处理 样品的采集、分离、纯化和培养参照SN/T 2589植物病原真菌检疫鉴定方法进行。 6.2 核酸的制备 采用基因组提取试剂盒制备DNA,或采用改良的CTAB提取法,参见附录A。 6.3 DNA纯度与浓度的测定 用微量紫外分光光度计测定DNA的纯度与浓度,分别取得260nm和280nm处的吸收值,计算核 酸的纯度和浓度,计算公式如下: 6.4 序列扩增测序 利用通用引物对ITS基因进行扩增测序(具体步骤见附录B),将序列在Genbank数据库或中国检 疫性有害生物DNA条形码数据库中进行比对,若与数据库中叶点霉属ITS基因序列相似性均大于 98%,则比对分析序列同源性。 7 结果判定 ITS基因序列长度大于500bp,在NCBI数据库或中国检疫性有害生物DNA条形码数据库中进行 比对分析,若与数据库中叶点霉属ITS基因序列(参见附录C)同源性大于98%,则判定该菌为叶点 霉属。 若测定序列与附录D检疫性叶点霉ITS参考序列同源性为100%,则判定该菌为葡萄苦腐病菌。 8 保......

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