搜索结果: SN/T 4877.15-2019, SN/T4877.15-2019, SNT 4877.15-2019, SNT4877.15-2019
| 标准编号 | SN/T 4877.15-2019 (SN/T4877.15-2019) | | 中文名称 | 基因条形码筛查方法 第15部分:检疫性叶点霉 | | 英文名称 | (Gene barcode screening methods - Part 15: Phytophthora) | | 行业 | 商检行业标准 (推荐) | | 中标分类 | C62 | | 国际标准分类 | | | 字数估计 | 12,113 | | 发布日期 | 2019-09-03 | | 实施日期 | 2020-03-01 | | 标准依据 | 海关总署公告2019年第142号 | | 发布机构 | 海关总署 |
SN/T 4877.15-2019: 基因条形码筛查方法 第15部分:检疫性叶点霉
SN/T 4877.15-2019 英文名称: (Gene barcode screening methods - Part 15: Phytophthora)
中华人民共和国出入境检验检疫行业标准
SN/T4877.15-2019
基因条形码筛查方法
第15部分:检疫性叶点霉
中华人民共和国海关总署 发 布
前言
本部分依据GB/T 1.1-2009给出的规则起草。
本部分由中华人民共和国海关总署提出并归口。
本部分起草单位:宁波检验检疫科学技术研究院、中华人民共和国宁波海关、中国科学院微生物研
究所、中国检验检疫科学研究院。
本部分主要起草人:段维军、蔡磊、郭立新、陈倩、段丽君、李雪莲、刘芳、赵文军、陈先锋。
SN/T4877.15-2019
SN/T 4877《基因条形码筛查方法》分为15个部分:
- - 第 1 部 分 : 检 疫 性 棒 形 杆 菌 ;
- - 第 2 部 分 : 检 疫 性 黄 单 胞 菌 ;
- - 第 3 部 分 : 检 疫 性 植 原 体 ;
- - 第 4 部 分 : 检 疫 性 茎 点 霉 ;
- - 第 5 部 分 : 检 疫 性 拟 茎 点 霉 ;
- - 第 6 部 分 : 检 疫 性 嗜 酸 菌 ;
- - 第 7 部 分 : 检 疫 性 轮 枝 菌 ;
- - 第 8 部 分 : 检 疫 性 炭 疽 菌 ;
- - 第 9 部 分 : 检 疫 性 腥 黑 粉 菌 ;
- - 第 1 0 部 分 : 检 疫 性 疫 霉 ;
- - 第 1 1 部 分 : 检 疫 性 异 株 苋 亚 属 ;
- - 第 1 2 部 分 : 黄 瓜 绿 斑 驳 花 叶 病 毒 ;
- - 第 1 3 部 分 : 检 疫 性 马 铃 薯 Y 病 毒 属 病 毒 ;
- - 第 1 4 部 分 : 检 疫 性 南 方 菜 豆 花 叶 病 毒 属 病 毒 ;
- - 第 1 5 部 分 : 检 疫 性 叶 点 霉 。
本 部 分 为 SN/T 4877的 第 1 5 部 分 。
基因条形码筛查方法
第15部分:检疫性叶点霉
1 范围
本部分规定了检疫性叶点霉DNA条形码筛查方法。
本部分适用于进境植物及其产品中检疫性叶点霉的筛查。
2 规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文
件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
SN/T 2589 植物病原真菌检测规范
3 术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
3.1 检疫性叶点霉属真菌
凭证标本是一种为鉴定或研究提供实物依据并具有足够存档信息(采集及鉴定信息等)而长期保存
的标本,它可以是完整的生物个体或其一部分,也可以是生物体的遗传物质。凭证标本的保存需要有详
细的标本编号、存放地点等详细信息,以便于日后查证。
DNA条形码是指生物体内能够代表该物种的,标准的、有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA
片段。研究人员用DNA条形码技术鉴定物种及物种间亲缘关系,修改已有的分类学结论等。
用于鉴定检疫性叶点霉属的DNA条形码如下:
4 方法原理
根据叶点霉属真菌的核糖体转录间隔区(ITS)的序列特征,应用DNA条形码技术对检疫性叶点霉
进行种类筛查,确定目标真菌是否为检疫性叶点霉及其种属归类。
5 仪器用具和试剂
5.1 仪器设备与用具
显微镜、高压灭菌锅、超净工作台、组织破碎仪、恒温水浴锅、台式冷冻离心机、微量分光光度仪、电
子天平、超纯水仪、漩涡振荡器、冰箱、微量移液器(0.5μL,2.5μL,10μL,20μL,200μL,1000μL)、常规PCR仪、核酸电泳仪、凝胶成像系统、DNA提取仪。
5.2 主要试剂
购置如下试剂或者相应的真菌基因组提取试剂盒:乙二胺四乙酸钠盐(Na2EDTA·2H2O)、氢氧
化钠(NaOH)、Tris碱、浓盐酸(HCl)、溴化十六烷基三甲铵(CTAB)、氯化钠(NaCl)、聚乙烯吡咯烷酮
(PVP)、冰醋酸(CH3COOH)、蒸馏水、氯仿(CHCl3)、异戊醇、70%乙醇。
PCR和电泳检测所需试剂:10×PCR缓冲液、脱氧核糖核苷三磷酸(dNTPs)、ExTaq聚合酶、引
物、超纯水、DL2000Marker、琼脂糖、GelRed核酸凝胶染料。
6 筛查鉴定方法
6.1 样品的采集与处理
样品的采集、分离、纯化和培养参照SN/T 2589植物病原真菌检疫鉴定方法进行。
6.2 核酸的制备
采用基因组提取试剂盒制备DNA,或采用改良的CTAB提取法,参见附录A。
6.3 DNA纯度与浓度的测定
用微量紫外分光光度计测定DNA的纯度与浓度,分别取得260nm和280nm处的吸收值,计算核
酸的纯度和浓度,计算公式如下:
6.4 序列扩增测序
利用通用引物对ITS基因进行扩增测序(具体步骤见附录B),将序列在Genbank数据库或中国检
疫性有害生物DNA条形码数据库中进行比对,若与数据库中叶点霉属ITS基因序列相似性均大于
98%,则比对分析序列同源性。
7 结果判定
ITS基因序列长度大于500bp,在NCBI数据库或中国检疫性有害生物DNA条形码数据库中进行
比对分析,若与数据库中叶点霉属ITS基因序列(参见附录C)同源性大于98%,则判定该菌为叶点
霉属。
若测定序列与附录D检疫性叶点霉ITS参考序列同源性为100%,则判定该菌为葡萄苦腐病菌。
8 保......
|