| 标准编号 | GB/T 34798-2017 (GB/T34798-2017) | | 中文名称 | 核酸数据库序列格式规范 | | 英文名称 | Formats specifications of nucleotide sequence database | | 行业 | 国家标准 (推荐) | | 中标分类 | A40 | | 国际标准分类 | 07.080 | | 字数估计 | 19,135 | | 发布日期 | 2017-11-01 | | 实施日期 | 2018-05-01 | | 标准依据 | 国家标准公告2017年第29号 | | 发布机构 | 中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局、中国国家标准化管理委员会 | GB/T 34798-2017
Formats specifications of nucleotide sequence database
ICS 07.080
A40
中华人民共和国国家标准
核酸数据库序列格式规范
2017-11-01发布
2018-05-01实施
中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局
中国国家标准化管理委员会发布
目次
前言 Ⅲ
1 范围 1
2 规范性引用文件 1
3 术语和定义 1
4 缩略语 2
5 核酸序列格式规范制定的总则 2
6 核酸序列描述规范 2
7 核酸序列特征描述规范 3
8 核酸序列格式规范 5
9 核酸序列文件整体格式规范 5
附录A(资料性附录) 核苷酸含义表 6
附录B(资料性附录) 与核酸相关的特征关键词表 7
附录C(资料性附录) 密码子表 10
附录D(资料性附录) 修饰碱基表 11
附录E(资料性附录) 限定词中英文对照表 13
附录F(资料性附录) 核酸序列文件样例 14
附录G(资料性附录) 行首大写字母含义表 15
参考文献 16
前言
本标准按照GB/T 1.1-2009给出的规则起草。
本标准由全国生化检测标准化技术委员会(SAC/TC387)提出并归口。
本标准起草单位.深圳华大基因研究院、深圳华大基因科技有限公司、广东省标准化研究院、广东产
品质量监督检验研究院。
本标准主要起草人.魏晓锋、陈凤珍、刘克、杜佳婷、李倩一、沈维燕、李启沅、谢强、王娟、谭嘉力、
宋祚锟、黄江勇。
核酸数据库序列格式规范
1 范围
本标准规定了核酸数据库的序列格式,包括生物体基因组核酸序列特征规范制定的总则、序列描述
格式规范、序列特征描述规范和序列格式规范等。
本标准适用于生物体基因组核酸数据库序列文件的编写。
2 规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文
件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T 29859 生物信息学术语
ZC0003 核苷酸和/或氨基酸序列表和序列表电子文件标准
3 术语和定义
GB/T 29859界定的以及下列术语和定义适用于本文件。
3.1
核酸数据库 nucleicaciddatabase
以核酸序列为基本内容,并附有核酸序列注释信息的数据库。
3.2
编码序列 codingsequence
编码一段蛋白产物的序列,始于起始密码子,终于终止密码子。
3.3
序列组装 sequenceassembly
基因组长序列打断之后形成较短的序列,通过算法和计算机的帮助,把这些短的序列组装起来成为
一条完整有序的序列的过程。
3.4
甲基化 methylation
蛋白质和核酸的一种重要的修饰,调节基因的表达和关闭。
3.5
识别码 identifier
某个体系中相对唯一的编码。
......
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